23
BAB III METODE PENELITIAN
A. Jenis dan Rancangan Penelitian
Penelitian yang berjudul “Desain dan sintesis senyawa 2-4’-hidroksi- 3
’-metoksibenzilidena sikloheksana-1,3-dion yang berpotensi sebagai senyawa antikanker dengan menghambat protein NF-
κB menggunakan metode solid phase reaction
” merupakan penelitian non-eksperimental deskriptif non-analitik karena pada penelitian ini tidak diberikan perlakuan pada subjek uji
dan hanya dipaparkan peristiwa yang terjadi sehingga tidak terdapat hubungan sebab akibat di dalamnya.
B. Definisi Operasional
1. PLANTS
PLP
score merupakan nilai atau output yang dihasilkan oleh PLANTS
setelah dilakukan proses docking menggunakan protokol yang telah ditentukan.
2. Starting material merupakan bahan awal yang digunakan dalam proses sintesis
2-4 ’-hidroksi-3’-metoksibenzilidena sikloheksana-1,3-dion. Starting material
yang digunakan,
yaitu sikloheksana-1,3-dion
dan 4-hidroksi-3-
metoksibenzaldehida.
3. Katalisator adalah senyawa yang digunakan dalam reaksi untuk mempercepat
terjadinya reaksi antara starting material. Katalisator yang digunakan dalam penelitian ini adalah kalium hidroksida KOH.
4. Molekul target merupakan senyawa hasil sintesis yang diharapkan terbentuk
dari hasil reaksi. Molekul target dalam penelitian ini adalah 2-4 ’-hidroksi-3’-
metoksibenzilidena sikloheksana-1,3-dion.
5. Rendemen senyawa hasil sintesis merupakan persentase perbandingan antara
jumlah senyawa murni yang diperoleh dari hasil sintesis dibandingkan dengan jumlah senyawa yang diperoleh secara teoritis. Dalam penelitian ini, rendemen
senyawa hasil sintesis adalah rendemen senyawa 2-4 ’-hidroksi-3’-
metoksibenzilidena sikloheksana-1,3-dion.
C. Bahan Penelitian
Struktur protein NF-
κB www.rcsb.org; kode PDB: 4G3G 4G3G.pdb,
sikloheksana-1,3-dion p.a, Aldrich, 4-hidroksi-3-metoksibenzaldehida p.a., Merck, kalium hidroksida p.a., Merck, asam klorida, n-heksan p.a., Merck, etil
asetat p.a., Merck, aquades Laboratorium Kimia Organik Universitas Sanata Dharma, kloroform p.a., Merck, etanol p.a., Merck, dan silika gel GF
254
Merck.
D. Alat Penelitian
Perangkat lunak
digunakan berupa
PLANTS www.tcd.uni-
konstanz.deresearchplants.php; MarvinSketch 5.11.5 2012, ChemAxon www.chemaxon.com; YASARA View 12.8.21 www.yasara.org; dan PyMol
versi 0.99 Delano Scientific LLC, USA. Docking dilakukan dengan menggunakan