23
BAB III METODE PENELITIAN
A. Jenis dan Rancangan Penelitian
Penelitian yang berjudul “Desain dan sintesis senyawa 2-4’-hidroksi- 3
’-metoksibenzilidena  sikloheksana-1,3-dion  yang  berpotensi  sebagai senyawa  antikanker  dengan  menghambat  protein  NF-
κB  menggunakan metode solid phase reaction
” merupakan penelitian non-eksperimental deskriptif non-analitik karena pada penelitian ini tidak diberikan perlakuan pada subjek uji
dan  hanya  dipaparkan  peristiwa  yang  terjadi  sehingga  tidak  terdapat  hubungan sebab akibat di dalamnya.
B. Definisi Operasional
1.  PLANTS
PLP
score merupakan nilai atau output yang dihasilkan oleh PLANTS
setelah dilakukan proses docking menggunakan protokol yang telah ditentukan.
2.  Starting material merupakan bahan awal yang digunakan dalam proses sintesis
2-4 ’-hidroksi-3’-metoksibenzilidena sikloheksana-1,3-dion. Starting material
yang digunakan,
yaitu sikloheksana-1,3-dion
dan 4-hidroksi-3-
metoksibenzaldehida.
3.  Katalisator adalah senyawa yang digunakan dalam reaksi untuk mempercepat
terjadinya  reaksi  antara  starting  material.  Katalisator  yang  digunakan  dalam penelitian ini adalah kalium hidroksida KOH.
4.  Molekul  target  merupakan  senyawa  hasil  sintesis  yang  diharapkan  terbentuk
dari hasil reaksi. Molekul target dalam penelitian ini adalah 2-4 ’-hidroksi-3’-
metoksibenzilidena sikloheksana-1,3-dion.
5.  Rendemen senyawa hasil sintesis merupakan persentase perbandingan antara
jumlah senyawa murni yang diperoleh dari hasil sintesis dibandingkan dengan jumlah senyawa yang diperoleh secara teoritis. Dalam penelitian ini, rendemen
senyawa  hasil  sintesis  adalah  rendemen  senyawa  2-4 ’-hidroksi-3’-
metoksibenzilidena sikloheksana-1,3-dion.
C. Bahan Penelitian
Struktur protein NF-
κB www.rcsb.org; kode PDB: 4G3G 4G3G.pdb,
sikloheksana-1,3-dion  p.a,  Aldrich,  4-hidroksi-3-metoksibenzaldehida  p.a., Merck, kalium hidroksida p.a., Merck, asam klorida, n-heksan p.a., Merck, etil
asetat  p.a.,  Merck,  aquades  Laboratorium  Kimia  Organik  Universitas  Sanata Dharma,  kloroform  p.a.,  Merck,  etanol  p.a.,  Merck,  dan  silika  gel  GF
254
Merck.
D. Alat Penelitian
Perangkat lunak
digunakan berupa
PLANTS www.tcd.uni-
konstanz.deresearchplants.php;  MarvinSketch  5.11.5  2012,  ChemAxon www.chemaxon.com;  YASARA  View  12.8.21  www.yasara.org;  dan  PyMol
versi 0.99 Delano Scientific LLC, USA. Docking dilakukan dengan menggunakan