4.5.2.2. Mamalia
Jenis mamalia yang terdapat di dalam kawasan adalah Duyung Dugong dugon, Paus biru Balaenoptera musculus dan Lumba-lumba Dolphinidae
sering dijumpai di sekitar perairan Windesi, P. Roswar dan P. Yoop. Beberapa jenis mamalia darat seperti Kuskus Phalanger sp, Babi Hutan Sus scrofa, Rusa
Timor Cervus timorensis dan Kanguru Tanah Thilogale spp dan Kalong Pterocarpus vampyrus dapat ditemukan pada hutan daratan pulau maupun pada
hutan di pulau induk Papua yang merupakan wilayah penyangga kawasan TNTC.
4.5.2.3. Reptil
Terdapat tujuh jenis penyu di seluruh dunia, enam diantaranya terdapat di perairan Indonesia, dan di dalam kawasan TNTC terdapat 4 jenis penyu yakni,
penyu sisik Eretmochelys imbricata dan Penyu hijau Chelonia mydas, Penyu lekang Lephidochelys olivacea dan Penyu belimbing Dermochelys coriacea.
Jenis reptil lain seperti Biawak abu-abu Varanus nebolosus, Biawak Coklat Varanus timorensis, Biawak Ambon Varanus amboinensis, Buaya Muara
Crocodylus porosus, Buaya Air tawar Crocodylus novaeguineae, Kadal dan ular. Terdapat beberapa lokasi yang dijadikan tempat peneluran penyu yaitu di P.
Wairundi, P. Sima, P. Iwari BBTNTC, 2009a.
4.5.2.4. Burung Aves
Pulau-pulau dan pantai di TNTC merupakan tempat bersarang dan mencari makanan yang paling penting bagi berbagai jenis burung, antara lain Junai Mas
Chaloenas nicobarica, Dara Laut Ducula sp., Camar laut Sterna sp. dll. Jenis-jenis burung ini memiliki daerah bersarang di P. Kumbur, Kuwom dan
Matas. Burung gosong Megapodius freicinet dan Elang laut dada putih Haliaetus leucogaster, pasangan-pasangan elang merupakan pandangan
menakjubkan ketika melayang-layang mengikuti arus udara di atas pulau-pulau. Daratan lumpur sekitar Sungai Wosimi dan pasir Sobei khususnya penting sebagai
tempat mencari makan bagi berbagai burung, termasuk burung Undan Australia Pelicanus conspicillatus yang ditemukan pada waktu-waktu tetentu selama
melakukan migrasi dan bangau kuntul Egretta Spp. BBTNTC, 2009a. Hasil kegiatan inventarisasi dan identifikasi burung yang dilakukan di
kampung Yende oleh Tim dari Balai Besar TNTC pada tahun 2008 diperoleh data
dan informasi mengenai jenis burung pada kampung Yende. Terdapat 38 jenis burung dimana 17 jenis diantaranya merupakan jenis burung yang dilindungi,
seperti : Cacatua galerita, Lorius roratus, Lorius lory, Eclectus roratus, Gracula religiosa, Haliastus indus, Alcedo euryzona, Alcedo coemlescens, Buceros
rhinoceros, Egretta sacra, Fregata minor, Sula leucogaster, Nyticorax
caledonicus, Megapodius reinwardt, Egreta eulophotes dan Goura cristata.
BBTNTC,2009a.
4.5.2.5. Ikan Fish