Genotiping Marka SNAP Bahan dan Metode

Tabel 4.3 Jumlah alel yang diamati pada setiap lokus marka SNAP untuk populasi kelapa Dalam dan Genjah Populasi WRKY 21 WRKY 22 WRKY 61 WRKY 63 WRKY 71 WRKY 191 WRKY 211 WRKY 213 SUS1 3 SUS1 11 SUS1 14 SUS1 17 ABI 3 SACP D1 SACP D2 SACP D3 DAG 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 DAI 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 DBG 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 DBI 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 DIO 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 DJA 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 DKL 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 DKN 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 2 2 DKY 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 2 DLO 2 2 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 DLP 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 DMA 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 DMT 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 DMW 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 DPA 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 DPL 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 DPN 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 DPU 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 DRS 2 2 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 DSA 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 DSE 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 2 DSN 2 2 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 1 2 DTA 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 DTE 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 DTS 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 DTT 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 DTU 2 2 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 DWA 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 GAK 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 GHJ 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 2 GHN 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 GKB 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 2 GKM 2 2 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 1 2 2 GKN 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 GMM 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 GOS 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 GRA 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 GSK 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 1 2 GMN 2 2 1 2 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 2 2 GTT 2 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 GWU 1 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 1 2 2 2 2 Total 81 81 62 74 80 79 69 80 81 53 80 66 70 45 62 81 Rerata 1.98 1.98 1.51 1.80 1.95 1.93 1.68 1.95 1.98 1.29 1.95 1.61 1.71 1.10 1.51 1.98

4.3.3 Frekuensi Alel Populasi Kelapa Dalam dan Genjah

Frekuensi alel dapat diklasifikasikan berdasarkan dua pengarang. Pertama, menurut sistem Buchert et al. 1997 yang membagi menjadi empat kategori. Alel dengan frekuensi ≥0.75 pada lokus tertentu dikategorikan sebagai tinggi, alel dengan frekuensi 0.25 ≤P0.75 dikategorikan menjadi sedang, alel yang memiliki frekuensi 0.01 ≤P0.25 dikategorikan sebagai alel rendah, dan alel dengan frekuensi 0.01 merupakan alel jarang. Kedua, menurut Marshall dan Brown 1975, alel-alel dikategorikan menjadi alel umum jika memiliki frekuensi ≥0.05 dan alel khusus jika frekuensinya 0.05. Klasifikasi alel berdasarkan Buchert et al. 1997 populasi kelapa Genjah Genjah Kuning Nias memiliki alel frekuensi tinggi sebesar 62.5 sedangkan